本公司批發市場是全臺灣最具規模的果菜集散中心，接受供應單位(人)委託，透過公開、公平、公正的交易制度將果菜批售給承銷業者，充分發揮「迅速集散」、「齊備貨色」、「形成價格」、「清算貨款」、「行情報導」等五大功能，交易價格最具全臺性指標，並依農產品市場交易法，按成交金額收取管理費，以維持營運所需。
批發市場現有電腦拍賣機82台，拍賣作業全面電腦化，作業嚴謹健全，每天下午來自全臺各地的新鮮果菜開始進貨，於隔日凌晨3時20分起陸續展開拍賣，承銷人以晶片感應方式完成交易，每日約有2,300公噸的蔬果，通常在3小時之內迅速拍賣完成，並分散至大臺北地區各零售市場供民眾選購。
設置農藥殘留檢驗室，抽樣篩檢進場果菜，不合標準者即拒絕交易並扣留銷毀，另採樣送請衛生主管機關以化學檢驗方法複驗，為市民食用果菜安全把關。

供應學校、機關、團體、監所等客戶約97家，蔬果年交易量約3,100公噸，年營業額約1億4千萬元。
供應連鎖超級市場約150餘家，蔬果年供應量約15,000公噸，年營業額約10億元。

建置果菜語音傳真查詢系統及臺北農產公司全球資訊網，提供產銷雙方及大眾媒體或消費者可利用電話傳真機或個人電腦，每天可即時查詢果菜交易行情、市況分析、拍賣交易明細及貨款資料等資訊。
更為加強服務產地供應單位(人)，以電腦e-mail方式提供快速寄發當日貨款清單，增加產地農友供貨信心。另編製果菜運銷統計月、年報，按時上網提供產、官、學各界參考。

因應行動裝置流行使用，本公司104年建置蔬果預約交易暨行情查詢APP系統，可提供承銷/供應業者建置線上進行買賣，拍賣員線上媒合以完成交易。行情查詢APP系統於當日拍賣交易完成，每隔10分鐘進行一次更新，產官學及供、銷雙方均可即時了解蔬果拍賣行情。
為呈現更透明之果菜拍賣交易資訊，強化交易作業、提升服務品質、本公司已於第一果菜批發市場裝設遠端監視系統，總計48支網路監視鏡頭，於105年7月上線，並發文提供共同運銷單位使用，全國各地農友可隨時透過手機APP行動裝置，24小時瞭解拍賣現場動態，增進供貨信心。

為因應市場所需，辦理進出口業務，協助台灣農民拓展農產品銷售通路。